Los troyanos se clasifican según las acciones que efectuan en los equipos de las víctimas.
* Puertas traseras (Backdoors)
* Troyanos en general
* Troyanos que roban contraseñas
* Clickers troyanos
* Descargadores troyanos (Downloaders)
* Droppers troyanos
* Proxies troyanos
* Espias troyanos
* Notificadores troyanos
* "Bombas" para compresores de archivos (ArcBombs)
* Rootkits